门派系统是游戏核心玩法之一，不同门派拥有独特的武学体系、天赋加成和剧情分支。选择门派需综合考虑属性成长、武学上限、剧情兼容性及后期发展潜力。少林派以根骨和防御见长，适合新手积累资源；武当派注重内功与太极奥义，中后期强度突出；古墓派剑法上限高达121，搭配玄铁剑法可形成高爆发输出；大轮寺属性成长最优但限制剧情路线；灵鹫宫则兼顾属性与内功灵活性。开局需根据周目难度和角色定位权衡，例如一周目建议少林或全真过渡，高周目可优先古墓或大轮寺追求极限数值。
门派剧情与时间轴紧密关联，需注意关键节点。以少林为例，俗家弟子需在3月16日前完成初祖庵修炼，剃度弟子则需兼顾后山悟性与大雄宝殿修行；武当派需在出师前完成宋远桥的侠义任务以获取太极神功；古墓派需通过叛徒事件解锁九阴真经残篇。各门派主线任务通常伴随属性奖励或武学解锁，如全真教九阴线需在特定道德值下触发，血刀门则需完成狄云相关任务链。系统时间每年推进NPC战力提升，需合理规划修炼与剧情进度。
少林韦陀棍需20级激活横扫千军套，搭配易筋经形成攻防一体；古墓玉女心经与玄铁剑法组合可触发高频率连击；武当纯阳无极功配合太极剑法释放奥义刚柔并济。需注意四项兵刃熟练度（拳掌、剑法、刀法、奇门）直接影响对应武学威力，如古墓派优先提升剑法至60全真教则需专注拳掌。内功选择上，九阴真经、血海魔功（吸血效果）、八荒六合唯我独尊功（灵鹫宫专属）是通用性较强的选项。
古墓派幽居提升多重攻击概率，全真教先天功增强内功效果，大轮寺金刚叠加防御，灵鹫宫逍遥降低暴击概率。天赋点分配需结合角色定位，如输出型优先素心神剑（双次攻击）、斗转星移（反弹伤害），生存型则选择神行百变（闪避）或沾衣十八跌（反制眩晕）。部分天赋需通过天关挑战或隐藏任务获取，如天地交征阴阳大悲赋需完成独孤嫣然事件。
隐藏门派如阴阳合欢宗、桃花岛等需满足特殊条件。前者需保持道德值为负并完成葛光佩任务链，后者需在迷宫触发黄药师试炼。隐藏门派通常提供稀有武学或天赋，但可能限制主线推进，如阴阳合欢宗姹女魔功虽强却无法回师门。需注意隐藏路线往往伴随高难度战斗，建议储备足够药品并提升队友强度。队友招募亦受门派影响，如郭襄离队事件与古墓派灭门任务关联，杨过入队需优先完成神雕线。
多周目玩法下，门派选择需兼顾继承性与挑战性。高周目推荐古墓派（剑法上限突破）、大轮寺（属性成长极致）或武当派（奥义泛用性强），并利用周目奖励解锁武学精通。残章掉落率提升后，可针对性刷取门派核心武学残章，如少林的龙爪手或灵鹫宫的天山六阳掌。最终阵容需平衡输出、控制与生存，例如搭配霍青桐（群体增益）、令狐冲（单体爆发）及程灵素（解毒医疗）形成互补。
