商店系统分散于游戏各个功能模块，玩家可通过主界面下方的功能入口进入不同类型的商店。竞技商店位于竞技场界面，装备商店在装备模块，联盟商店需加入联盟后解锁，而名将商店则需通过主界面下方的商店按钮进入名将标签页。这些商店会随玩家等级提升逐步开放，初期未出现的商店无需着急，继续推进游戏进度即可解锁。
竞技商店是早期可接触的重要资源获取点，玩家通过每日完成竞技场挑战积累声望，用于兑换武将碎片或进阶丹。装备商店提供不同品质的装备，橙色装备性价比较高，紫色装备仅建议前期过渡使用。宝物商店需通过抢夺碎片获得货币，优先兑换虎符和精炼石更为划算。联盟商店需消耗联盟贡献值，该资源通过完成联盟任务或捐献获取，建议每日清空任务以稳定积累贡献。
神将商店是获取高品质武将的核心渠道之一，玩家可将不需要的武将分解为将魂，用于兑换心仪的橙色或紫色武将碎片。建议常备2000将魂以应对整卡兑换机会。心愿商店则是后期获取金装和金神兵的重要途径，每日完成心愿任务可积累水晶兑换稀有道具。问鼎商店隐藏于问鼎中原玩法中，需通过参与军团活动获取威望兑换培养材料，高阶道具需长期规划资源分配。
签到商店和友情商店等次要商店同样不可忽视。签到商店会根据登录天数提供阶段性奖励，优先兑换精英关卡挑战次数或核心武将碎片能加速战力成长。友情商店则消耗友情点购买蓝装碎片等基础资源，适合补充日常消耗。需注意部分商店商品存在限购或定时刷新机制，合理规划货币使用顺序可最大化资源收益。
