方舟沉船区域的玩法其实跟一个叫魔法季的季节任务紧密相关，它并不是一个会突然变化的地图，而是需要你完成一系列固定的收集任务来逐步解锁和激活。这个区域官方名字通常叫遗忘方舟，它就藏在暮土地图的右边，你需要从暮土大厅出发，向右飞找到水边的一个小码头，那里停着一艘破旧的小船，你靠近它点击祈祷按钮，它就会载着你晃晃悠悠地驶向那片神秘的沉船区域。刚去的时候，那里可能显得有点荒凉破败，但你的任务就是让这片土地重新焕发生机。
让方舟沉船区域变起来的核心，就是去完成魔法季向导先祖交给你的六个灵体收集任务。这六个灵体就是六种不同颜色的光芒，它们分别散落在游戏里各个不同的地图角落。你需要按照顺序或者自己规划路线，一个一个去找到并带回方舟。每当你成功找回一个灵体并把它交还给方舟土地上对应的石碑，方舟区域就会发生一点小小的变化，比如被污染的黑水会褪去一片，土地会恢复一点光泽，或者又多点亮一盏灯。这个过程就像是在一点点净化这片土地，特别有成就感。
红色光芒就在方舟沉船后面的农田区域转悠，你很容易看到。蓝色光芒需要你跑到霞谷的溜冰场，它可能浮在水面上也可能藏在冰面下。青色光芒躲在云野刚进门那片厚厚的云层里，需要你飞进去找。绿色光芒会从云野的浮石岛屿地图上空慢慢飘落下来。紫色光芒在禁阁那个需要两个人才能打开的双人门隐藏图里，在一个浮台上。橙色光芒则出现在雨林栈桥图左边的树林中。把它们全部收集齐，是让方舟彻底活过来的关键。
当你费尽力气把所有光芒都收集完毕，并全部归还到方舟的石碑上之后，整个遗忘方舟区域就会完全变样了。原本被黑暗植物覆盖、黑水淹没的土地会变得干净整洁，所有的建筑和设施都会被点亮，魔法商店也会正式营业。这个商店里会出售各种有趣的魔法道具，比如能让角色漂浮起来的魔法，或者让身体发光的魔法，这些都是你辛苦完成任务后的奖励。
这时候的方舟才算是它的完全体，从一个废弃的遗迹变成了一个功能齐全、灯火通明的魔法基地。你完全可以一个人慢慢完成，虽然有些地图可能需要一点小技巧，比如霞谷水下收集水之灵要注意氧气，或者躲避墓土沉船图里巡逻的冥龙。但基本上没什么特别难的门槛，多试几次熟悉路线就好了。完成整个方舟任务后，你不仅能解锁魔法商店，还能从向导先祖那里获得爱心等奖励。
