基地防御的核心是构建多层次的防空体系，维塔斯B型轰炸机（维B）是大型战斗机的首选，其等离子炸弹对大型舰船有显著压制效果，但需依赖KCCPV2.0载机巡洋舰或航母搭载。该机型需近距离投放武器，对载机平台的生存能力要求较高，装甲强化型舰船或配备完整护航编队的平台更为合适。维B的综合性能突出，是后期对抗敌方主力舰队的核心战力。
中型战斗机中，林鸮凭借均衡的对空对舰能力成为防守中坚，可有效拦截敌方舰载机群并威胁中小型舰船。孢子战斗机作为专职空战机种，其区域防空能力适合应对集群敌机，但需注意其防空机制依赖信号指引系统，实战中可能出现锁定延迟。砂龙（沙地龙兽）属于主动攻击型中型机，适合配合防御体系主动清除威胁目标。这三类机型技术门槛相对较低，是中期基地防空的主力。
大型轰炸机刺鳐属于泛用性较低的次级选择，其输出效率不足；牛蛙单发火力薄弱且对舰能力有限，均不适合作为防守核心。安德森虽能补充一定输出，但需依赖特定战术体系支撑。护航艇如T800、蜂巢可辅助拦截小型目标，但无法替代战斗机职能。技术值分配应优先保障维B和林鸮的满级强化，孢子次之，避免分散投入到低效机型。
实战部署需严格遵循舰船搭载规则，确认载机舰的大型机库模块激活且指挥值充足。基地防卫机库配置应以维B和林鸮为主，孢子为辅，形成火力梯度。防守时优先开启舰载机的防御加强技能提升生存率，遭遇敌方战斗机突袭时及时启动贯穿技能反击。多机组协同可构建交叉火力网，弥补单一机型盲区。定期通过模拟对抗优化编队组合，记录战损数据调整技术点分配。
